实时荧光定量PCR是分子生物学的核心检测技术,通过在PCR扩增中引入荧光标记,实现对目标核酸的精确定量。其“实时”特性指在DNA扩增过程中同步监测荧光信号的变化,而“定量”则可准确测定目标基因的拷贝数。该技术从传统PCR发展而来,引入荧光检测后,完成了从定性到定量的突破。
在分子诊断领域,实时荧光定量PCR已成为病原体检测和基因表达分析的金标准,相比传统终点PCR,具有避免污染、动态范围广、灵敏度高的优势。实时荧光定量PCR由美国应用生物系统公司(ABI)于1996年推出,随后在全球广泛应用。疫情期间,它作为关键检测手段助力全球抗疫,也让公众对其有了更深入的了解。
一、实时荧光定量PCR的检测原理是什么?
实时荧光定量PCR技术建立在PCR(聚合酶链式反应)的基础上,在反应过程中,目标DNA片段会经历变性(95℃)、退火(60℃左右)和延伸(72℃)3个阶段。每经过1个循环,目标片段的数量就会翻倍。通过在反应体系中加入能与DNA结合的荧光探针或染料,随着目标DNA的扩增,荧光信号也会同步增强。
仪器通过记录每个循环的荧光强度,就能计算出起始样本中的DNA含量。这个过程通常需要进行35—45个循环。扩增效率在理想条件下接近100%,即每个循环DNA数量翻倍。仪器通过检测每个循环的荧光值,绘制扩增曲线,根据阈值线与扩增曲线的交点确定Ct值(阈值循环数)。实时荧光PCR反应的核心是指数扩增原理,理论上每一个循环中目标DNA片段数量都会翻倍。
实际操作中,前期循环反应效率最高,呈现指数增长;中期循环保持线性增长;后期由于反应物耗尽,进入平台期。正是这种精确的数学模型,使得从荧光信号到DNA定量的转换成为可能。在临床应用中,通常采用Ct值40为阳性判断标准,这一数值的确定基于大量实验数据和临床验证。
二、荧光检测系统有哪些类型?
荧光检测系统主要分为两大类:探针法和染料法。探针法使用带有荧光基团的特异性探针(如TaqMan探针),只有当探针与目标序列完全匹配时才会发出荧光,特异性很高。染料法虽然特异性较差,但通过溶解曲线分析可以部分弥补这一缺陷。染料法则使用能与双链DNA结合的荧光染料(如SYBR Green),操作简单但特异性较差。选择哪种方法,要根据具体实验需求来确定。
除了上述两种主流荧光检测系统外,还有多种特殊类型的检测方法不断涌现。分子信标(Molecular Beacon)探针利用发夹结构设计,在未结合靶序列时自我淬灭,结合后打开发夹结构发出荧光。双标记探针(Double-labeled Probes)在两端分别标记荧光基团和淬灭基团,当探针被DNA聚合酶降解时释放荧光。
三、定量分析是如何成功实现的?
实时荧光定量PCR有两种定量方式:绝对定量和相对定量。绝对定量需要建立标准曲线,通过一系列已知浓度的标准品,确定未知样本中的核酸拷贝数。相对定量则是通过比较目标基因与内参基因的表达比值,计算不同样本间基因表达量的相对变化。在临床病毒检测中多用绝对定量,而基因表达研究则常用相对定量。
四、实时荧光定量PCR技术的操作流程是怎样的?
实验室在收到样本后,先提取核酸,这是检测的基础。核酸提取完成后,加入特定的引物探针和其他反应试剂,确保反应体系配制准确。将反应混合液加入反应板中,放入实时荧光PCR仪器进行扩增检测。整个过程在2—4小时内完成,最后由计算机分析数据生成报告。
五、实时荧光定量PCR技术在生活中最为常见的应用是什么?
疫情期间的核酸检测让大众深入了解实时荧光定量PCR技术,其在医疗领域的广泛应用。核酸检测可用于检测流感、肝炎等传染病病毒,助力快速确诊;在肿瘤诊疗中,可监测癌症标志物,评估治疗效果和预后;在临床用药时,通过基因检测为医生提供精准治疗方案,提升疗效;在孕期检查中,可早期发现胎儿遗传疾病的风险;在传染病诊断中,不仅能定性检测,还能通过病毒载量评估治疗效果;在肿瘤诊断中,可检测基因突变或表达水平变化;在药物基因组学研究中,可用于预测药物反应并指导个体化治疗。
六、如何确保检测结果的准确性?
检测的准确性首先取决于规范的操作流程。采样人员必须经过专业培训,掌握正确的取样方法和防护要求。样本运输要保证冷链,送检时间要严格控制在有效期内。
实验室操作必须在生物安全柜中进行,试剂要定期进行效果验证。每次检测都要设置质控品,包括阳性对照、阴性对照和内参基因对照。
当发现任何异常情况,如质控结果不合格,必须立即停止检测并查找原因。实验室要定期参加室间质评,通过外部评价来验证检测的可靠性。
七、检测报告上的数据代表什么?
以新冠核酸检测为例,一份标准的检测报告包含几个关键信息。最基本的是定性结果,也就是“阴性”或“阳性”的判断,这直接告诉我们体内是否存在病毒。报告中的Ct值反映了病毒的多少,这个数值越小,说明体内的病毒数量越多。
ORF1ab和N是新冠病毒特有的基因片段,检测这些片段能够准确识别是否感染了新冠病毒。报告中还会包含内参基因的检测结果,这是用来确认样本质量是否合格的重要指标,确保整个检测过程的可靠性。
(广西壮族自治区玉林市第二人民医院 张丽)